预处理设备。首先对设备进行预处理，这包括预冷设备，通常需要预冷30分钟以上。清理冻干机冷阱中以及管道内部的冷凝水，确保设备干净卫生。

准备样品。将样品放入样品架，注意样品也需要预冷。对于含有有机溶剂的样品要特别小心，因为这些溶剂可能会损坏真空泵或造成危险。

密封设备。盖上有机玻璃罩，确保设备密封良好。

启动设备。启动制冷机和真空泵，开始冷冻和真空干燥过程。

监控过程。在干燥过程中，监控温度、气压和真空度的变化，确保设备正常运行。

结束干燥。干燥结束后，先放气再关闭真空泵和制冷机。

清理设备。待冷阱中的冰霜自然融化后，通过排水阀门排出，并清洁设备。

需要注意的是，用户应确保了解设备的具体操作指南，并遵循制造商的说明进行操作。